Trước phiên phúc thẩm, từ trại tạm giam, ông Chung đã gửi đến Tòa cấp cao bản giải trình dài gần 60 trang, khẳng định đã yêu cầu dừng các dự án về công nghệ thông tin nhiều lần trước khi yêu cầu ông Nguyễn Văn Tứ - nguyên giám đốc Sở Kế hoạch và đầu tư - ngừng triển khai gói thầu số hóa.
Ông Chung khẳng định, việc chỉ đạo dừng gói thầu theo ông Chung là đúng quy định, và cho rằng việc ông bút phê đồng ý đề xuất cho Công ty Nhật Cường thực hiện thí điểm số hóa hồ sơ doanh nghiệp "là đúng nguyên tắc".
Tòa cấp sơ thẩm cáo buộc hành vi trên của ông Chung tạo điều kiện giúp Nhật Cường tham gia gói thầu, trúng thầu. Ông Chung cho rằng cáo buộc này là "suy diễn thiếu căn cứ, không khách quan" và mong tòa ra quyết định “thấu tình đạt lý”.
Ngoài ra, thông qua các luật sư, ông Chung đã nộp bổ sung nhiều tài liệu, trong đó có hồ sơ bệnh án của Bệnh viện đa khoa quốc tế Vinmec; hồ sơ bệnh án của Phòng khám đa khoa quốc tế Vietsing; hồ sơ bệnh án của Bệnh viện K; biên bản khám và hội chẩn bệnh nhân ngày 18.10.2020 tại Bệnh viện 19/8 Bộ Công an. Các bệnh án đều chẩn đoán ông Chung bị ung thư trực tràng, theo dõi di căn phổi.
Đồng thời, ông Chung cũng nhờ nộp 85 bằng khen, giấy khen, kỷ niệm chương, huân chương… trong suốt quá trình công tác của mình từ công an cho đến chủ tịch UBND TP.Hà Nội. Ông Chung cũng nộp nhiều bằng khen, giấy khen của bố, mẹ và nhiều đơn xin giảm nhẹ tội cho ông của nhiều cá nhân, tổ chức.